- Süleyman Demirel Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi
- Vol: 11 Issue: 1
- Investigation of Androgen Responsive Elements in Some Autophagy Related Genes via in silico Analysis
Investigation of Androgen Responsive Elements in Some Autophagy Related Genes via in silico Analysis
Authors : Yalçin Erzurumlu
Pages : 71-77
Doi:10.22312/sdusbed.644853
View : 17 | Download : 2
Publication Date : 2020-03-03
Article Type : Research
Abstract :Amaç: Otofaji, hasarlı organellerin, hatalı katlanmış veya uzun ömürlü proteinlerin, ökaryotik hücrelerde lizozom aracılı uzaklaştırılmasından sorumlu olan majör bir hücresel yoldur ve mayadan memelilere kadar iyi düzeyde korunmuş fizyolojik mekanizmadır. Otofaji, nörodejeneratif hastalıklar, bulaşıcı hastalıklar, metabolik hastalıklar ve kanserinde dahil olduğu çok çeşitli patolojilerle ilişkilendirilmiştir. Son çalışmalar otofajinin prostat kanserindeki rolünü vurgulamaktadır. Bu nedenle, otofajinin bilinmeyen mekanizmalar ile gerçekleşen regülasyonu ve özellikle androjen aracılı gerçekleşen regülasyonu hakkındaki bilinmeyen süreçlerin anlaşılması önem taşımaktadır. Bu çalışmada otofaji ile ilişkili genlerin promotor bölgesinde in silico analizler ile varsayılan ARE’leri araştırmayı amaçladık. Materyal-Metod: Otofaji ile ilişkili hedef genlerin promotör dizileri UCSC ve EPD veri tabanından ekstrakte edilerek, androjen resepötörü bağlanma motifi için varsayılan bağlanma bölgeleri matinspector biyoinformatik aracı ile analiz edildi. Bulgular: İn silico analiz sonuçlara göre otofaji ile ilişkili 33 farklı genin promotor bölgesinde varsayılan ARE’ler tanımlandı. Sonuç: Sonuçlarımız otofaji ile ilişkili komponentlerin androjen sinyalizasyonu ile sıkı şekilde düzenlenebileceğini önermektedir.Keywords : Otofaji, Androjen cevap elementleri, Prostat kanseri, in silico analiz