- Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Dergisi
- Vol: 14 Issue: 1
- Investigation of Potential Antibacterial Properties of Some Azo Compounds by Molecular Docking Metho...
Investigation of Potential Antibacterial Properties of Some Azo Compounds by Molecular Docking Method
Authors : Çiğdem Karabacak Atay, Tahir Tilki, Bülent Dede
Pages : 150-154
Doi:10.29233/sdufeffd.544174
View : 19 | Download : 9
Publication Date : 2019-05-31
Article Type : Research
Abstract :Bu çalışmada, önceki çalışmalarımızda sentezlediğimiz üç azo boyarmaddenin, 2 - [(3,5-diamino-1H-pirazol-4-il)diazenil]-5-nitrobenzoik asit (A), 2-[(3,5)-dimetil-1H-pirazol-4-il) diazenil]-5-nitrobenzoik asit (B) ve 2-[(5-amino-3-metil-1H-pirazol-4-il) diazenil]-5-nitrobenzoik asit (C), potansiyel antibakteriyel özelliklerini araştırmak için moleküler doking çalışmaları yapıldı. Modelleme, SwissDock web sunucusunda EADock DSS algoritması kullanılarak gerçekleştirildi. Olası bağlanma konformasyonları ve inhibe edici etkileri belirlemek için E . coli beta-ketoaçil-açil taşıyıcı protein sentaz III (KAS III) aktif bölgesine ligandların (A, B ve C) bağlanma simülasyonları yapıldı. Doking sonuçları ayrıca ticari bir antibakteriyel madde olarak kullanılan triklosan ile karşılaştırıldı ve B bileşiğinin en iyi antibakteriyel özelliğe sahip olduğu bulundu.Keywords : Moleküler kenetlenme, Azo bileşik, Antibakteriyel özellikler, Protein