- Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
- Vol: 25 Issue: 2
- Cyclo(Tyr-Tyr) Dipeptidinin Teorik IR, Raman ve Moleküler Yapı Analizi
Cyclo(Tyr-Tyr) Dipeptidinin Teorik IR, Raman ve Moleküler Yapı Analizi
Authors : Sefa Çelik, Sevim Akyüz, Ayşen Özel
Pages : 401-409
Doi:10.19113/sdufenbed.881399
View : 16 | Download : 3
Publication Date : 2021-08-20
Article Type : Research
Abstract :Bu çalışmada HT-29, Hela ve MCF-7 hücre hatlarına karşı antikanser etki gösteren Cyclo(Tyr-Tyr) dipeptidinin olası en kararlı yedi konformasyonu tirozin aminoasilerinin χ yan zincir dihedral açılarına bağlı olarak konformasyon analizi yapılarak belirlenmiştir. Konformasyon analizi sonrasında belirlenen konformasyonlara ait geometrik yapılar, yan zincire ait dihedral açıdaki değişimler ve konformerlerin toplam ve bağıl enerjileri ile bu konformasyonların toplam enerjilerine katkı sağlayan van der Waals, elektrostatik, torsiyon enerji katkıları ayrı ayrı hesaplanmıştır. Ek olarak bu dipeptidin dimerik formu, kuantum kimyasal ab-initio hesaplamalarla optimize edilerek halka yapıya ait w, φ, Ψ dihedral açıları monomer form ile karşılaştırmalı olarak verilmiştir ve dimerik formu oluşturan moleküller arası hidrojen bağları belirlenmiştir.Keywords : Cyclo(Tyr-Tyr), Dipeptit, Diketopiperazin, Konformasyon Analizi, Moleküler Modelleme