- Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
- Vol: 23 Issue: 1
- DNA Microarray Gene Expression Data Classification Using SVM, MLP, and RF with Feature Selection Met...
DNA Microarray Gene Expression Data Classification Using SVM, MLP, and RF with Feature Selection Methods Relief and LASSO
Authors : Kıvanç Güçkiran, Ismail Cantürk, Lale Özyilmaz
Pages : 126-132
Doi:10.19113/sdufenbed.453462
View : 9 | Download : 5
Publication Date : 2019-04-01
Article Type : Research
Abstract : DNA Mikroçip teknolojisi, çok sayıda gen ifadesinin aynı anda gözlemlenebilmesini sağlayan özgün bir yöntemdir. Günümüzde bu gen ifadeleri bir çok hastalığı teşhis etmek için kullanılmaktadırlar. Bu çalışma iki özellik seçimi ve ağ yapısını çaprazlayarak birden çok verisetinde karşılaştırma yapmaktadır. Mikroçip verisetlerinde her bir örneğin gen sayısı çok sayıda olduğu için, bilgi kazancı en yüksek olan gen seçimi yapılmalıdır. Bu seçim için Relief ve LASSO özellik seçimi yöntemlerini kullandık. En önemli genler örnekten seçildikten sonra Destek Vektör Makinası (DVM), Çok Katmanlı Algılayıcı (ÇKA) ve Rastgele Orman (RO) gibi sıklıkla kullanılan sınıflandırıcılar kullanılarak veri sınıflandırıldı. LASSO özellik seçimi ve DVM daha önceki çalışmaları doğruluk ve eğitim hızı bakımından geride bırakmaktadır.Keywords : DNA Mikroçip, Destek Vektör Makinaları, Çok Katmanlı Algılayıcı, LASSO, Relief, Gen ifadesi