- Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
- Vol: 22 Issue: 2
- Domuz Jelatinine Özgü DNA Aptamerlerinin Seçilimi ve Karakterizasyonu
Domuz Jelatinine Özgü DNA Aptamerlerinin Seçilimi ve Karakterizasyonu
Authors : Abdullah Tahir Bayraç, Berke Bilgenur Kandemir
Pages : 774-778
Doi:10.19113/sdufbed.88900
View : 12 | Download : 8
Publication Date : 2018-08-15
Article Type : Other
Abstract :Aptamerler farklı hedeflere yüksek etkin ve özgünlükte bağlanabilen DNA ve RNA moleküllerdir. Bu çalışmada domuz jelatininin algılanmasında kullanılmak üzere DNA aptamerleri geliştirilmiştir. Aptamerlerin seçilimi için tekrarlı, negatif seçilim bulunan bir SELEX metodu takip edilmiş ve kütüphaneler bu yolla zenginleştirilmiştir. Zenginleştirilen kütüphaneler tarafımızca modifiye edilmiş bir metagenomik dizileme metodu kullanılarak yeni nesil dizileme sistemi Miseq ile dizilenmiş ve elde edilen yüksek hacimli veriden aday aptamer dizileri uygun biyoinformatik araçlar kullanılarak belirlenmiştir. Floresan modifiye olarak üretilen aday DNA aptameri domuz jelatinine karşı yüksek afinite göstermekte balık ve sığır jelatinine görece düşük afinite ile bağlanmaktadır. Bu çalışmada geliştirilen aptamer gıda tağşişlerinin belirlenmesi için kullanılacak sensörlerin geliştirilmesinde potansiyel algılama ajanı olarak kullanılabilecektir.Keywords : Aptamer, SELEX, Jelatin, Domuz