- Sinop Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi
- Vol: 1 Issue: 2
- Bazı Poaceae üyelerinde arpa ve buğday EST-mikrosatellit markırlarının aktarılabilirliği
Bazı Poaceae üyelerinde arpa ve buğday EST-mikrosatellit markırlarının aktarılabilirliği
Authors : HÜLYA SİPAHİ, Yeliz Aslan, Ayşen Yumurtacı
Pages : 102-113
View : 15 | Download : 2
Publication Date : 2016-12-31
Article Type : Research
Abstract :Normal 0 21 false false false MicrosoftInternetExplorer4 /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Normal Tablo"; mso-tstyle-rowband-size:0; mso-tstyle-colband-size:0; mso-style-noshow:yes; mso-style-parent:""; mso-padding-alt:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt; mso-para-margin:0cm; mso-para-margin-bottom:.0001pt; mso-pagination:widow-orphan; font-size:10.0pt; font-family:"Times New Roman"; mso-ansi-language:#0400; mso-fareast-language:#0400; mso-bidi-language:#0400;} Fusariım enfeksiyon koşulları altında oluşturulmuş eksprese olan dizi (EST) kütüphanelerinden geliştirilen arpa ve buğday mikrosatellit markırlarının türler/cinsler arası aktarılabilirlikleri, 8 Aegilops , 6 Triticum türü ile , Zea mays, Avena sativa ve Oryza sativa ‘yı içeren 17 türde belirlenmiştir. Arpa mikrosatellit primerleri için aktarılabilirlik oranı %29 ila %100 arasında değişmiştir. Cinsler arası en yüksek ( %100) aktarılabilirlik Avena da not edilmiş, bunu Zea (%92) , Triticum ( %83) , Aegilops (68%) ve Oryza (%8) takip etmiştir. Primer çiftleri, Triticum türleri içerinde oldukça yüksek aktarılabilirdir ( T. turgidum durum durum da %100, T. turgidum durum dicoccon ve T. monococcum aegilopoides da %92 ,T.timopheevii timopheevii ve T. turgidum dicoccoides de %83 , T. timopheevii armeniacum da %67). Yalnızca bir primer çifti (contig624) çalışılan tüm materyallerde, %100 tür/cinsler arası çoğaltım göstermiştir. Buğday mikrosatellitleri değerlendirildiğinde, mikrosatellit primer çiftleri Triticum türleri içinde oldukça aktarılabilirdir (%70 ila %100 arasında) ancak akraba tahıllarda düşük aktarılabilirdir ( Avena da 15%, Oryza da 50%, Zea da 45%, Hordeum da 60%). İki primer çifti yalnızca bazı Triticum türlerinde aktarılabilirlik göstermişken, diğer iki primer çifti sadece Aegilops ve Triticum türlerinde çoğaltım göstermiştir. EST mikrosatellite markırlarının bu yüksek tür/cinsler arası aktarılabilirliği, genomun ifade edilen bölgesine ait DNA diziliminin yüksek derecede korunduğunu ve bunların karşılaştırılmalı genom haritalamalarında, genetik çeşitlilikte ve filogenetik analizlerde uygunluklarını göstermektedir.Keywords : mikrosatellit marker, aktarılabilirlik, tahıl